kisukeのLINE接続を解除したい

複数のwebhookと連携しているためリッチメニューが反映されず一度kisukeのLINE接続を解除したいのですが、その場合Shopify上でアプリの削除を行えばよいでしょうか？

基本的には、アプリ削除すれば連携自体はできませんので、
そのまま削除を実施してください。